在非法集资案件中，员工责任的处理是一个复杂且关键的问题。

首先，需要明确的是，员工在非法集资案件中的责任取决于其在案件中的具体行为和作用。如果员工对非法集资活动不知情，仅仅是执行上级的工作指令，那么其责任可能相对较轻。然而，如果员工积极参与策划、组织、宣传或直接实施非法集资行为，那么就应当承担相应较重的法律责任。

对于责任的认定，司法机关通常会综合考虑多种因素，如员工的职位、工作内容、参与程度、是否获取非法利益等。在处理员工责任时，常见的方法包括：

1. 刑事处罚：对于构成犯罪的员工，依法追究刑事责任，如判处有期徒刑、拘役、罚金等。

2. 行政处罚：对情节较轻、不构成犯罪的员工，给予行政处罚，如罚款、吊销从业资格等。

3. 民事赔偿：如果员工的行为给投资者造成了经济损失，可能需要承担民事赔偿责任。

然而，这些处理方法也存在一些潜在风险：

1. 证据收集困难：要准确认定员工的责任，需要充分的证据支持。但在非法集资案件中，证据往往较为复杂和隐蔽，收集和固定证据存在一定难度。

2. 责任划分不清晰：由于非法集资活动通常涉及多个环节和人员，有时难以清晰地划分每个员工的具体责任，可能导致处理结果不公平。

3. 对企业正常运营的影响：大规模处理员工可能会对企业的正常运营造成冲击，影响企业的生存和发展，进而对经济和就业产生一定的负面影响。

4. 社会稳定风险：如果处理不当，可能引发员工及其家属的不满和抗议，影响社会稳定。

为了更清晰地展示上述内容，以下是一个简单的表格：

处理方法 潜在风险 刑事处罚 证据收集困难 行政处罚 责任划分不清晰 民事赔偿 对企业运营和社会稳定的影响

总之，在处理非法集资案件中的员工责任时，需要综合考虑各种因素，遵循法律程序，确保处理结果的公正、合理和有效，同时也要尽量减少潜在风险带来的不利影响。

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